湯瑪斯（狄倫歐布萊恩Dylan O'Brien 飾）、米諾（李基弘Ki Hong Lee 飾）一行人被帶到一座神秘的庇護所，這個機構由表裡不一的詹森（艾丹·吉倫Aidan Gillen 飾）所管理，詹森為他們提供安穩且舒適的環境，並下令讓幽地鬥士們在醫療實驗室中接受一連串的測試，詹森向托馬斯保證將會把他們送到更加安全的保護區與其他對「閃焰症病毒」免疫的年輕人一同居住。察覺事有蹊蹺的湯瑪斯決定再次帶領他的夥伴們逃出詹森的掌控，然而等待他們的，卻是比迷宮更加危險的焦土。本片改編自詹姆斯達許納撰寫的同名反烏托邦科幻小說三部曲的第二部。