湯瑪斯（狄倫歐布萊恩飾）率領的林間鬥士在經歷了迷宮逃脫和末日殭屍的生死考驗後，終於迎來最後的正邪較量。由托馬斯、紐特（托馬斯桑斯特飾）等人領軍的救援團隊，耗時三年籌劃營救被抓走的米諾，卻意外地發現米諾不在劫獲的那截火車上。經調查得知，米諾深陷在WCKD組織的控制之中，托馬斯和紐特毅然決定起身前往被稱為「最後之都」的人類最後淨土，更不惜利用背叛林間鬥士投身WCKD的特蕾莎（卡雅·斯考達裡奧飾）闖入WC​​KD，營救米諾和其他人。